News
| 12/2025 | DeepSpaceDBを紹介する記事を、「実験医学」に掲載しました。 |
| 10/2025 | DeepSpaceDBを紹介する論文が、「Nucleic Acids Research」データベース特集号に掲載されました。 |
| 03/2025 | DeepSpaceDBの使用方法に関するプロトコルを、「実験医学」に掲載しました。 [pdf] |
Research Interests
1
空間トランスクリプトームデータベース「DeepSpaceDB」の構築。
2
単細胞および空間転写データから生物学的なパターンの抽出。一つの例はこちら。
4
大規模遺伝子発現データの分析、技術的バイアスの除去、遺伝子調節ネットワークの予測と解析。
5
刺激によって引き起こされるエピゲノムマーカーの変化、及び転写に与える影響の解析。
Teaching
2017年以降、私は京都大学で統計、データ解析、バイオインフォマティクス、およびRプログラミングを教えています。
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Career Summary
| 2022 – 現在 |
准教授
医生物学研究所（LiMe）、京都大学
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| 2017 – 2022 |
講師
ウイルス・再生医科学研究所（INFRONT；現 医生物学研究所）、京都大学
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| 2014 – 2017 |
Immuno-Genomics Research Unitのユニット・リーダー
免疫学フロンティア研究センター、大阪大学
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| 2012 – 2017 |
特任助教
免疫学フロンティア研究センター、大阪大学
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| 2009 – 2012 |
特任研究員
免疫学フロンティア研究センター、大阪大学
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| 2009 |
博士（生命科学）
東京大学
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| 2004 |
修士（分子生物学）
ゲント大学（ベルギー）
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| 2003 |
学士（生化学）
KHBO（ベルギー）
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